Пока Усама все еще находился в Саудовской Аравии в 1989 году, он разозлил саудовскую королевскую семью своими поучениями и финансированием убийств социалистических лидеров в соседнем Йемене, родине его отца, ведь страны в то время старались воссоединиться под управлением единого коалиционного правительства.

В 1992 или 1993 году Бин Ладен послал тайного агента, Кари эль-Саида, с $40,000 в Алжир, дабы помочь местным исламистам и убедить их не идти на уступки с нечестивым правительством. Им сказали, что ведение джихада «лишь ради политики, а не ради Господа» есть грех, поэтому всеобщая война была единственным возможным решением. Последовала тотальная война, унесшая в страшных бойнях многих гражданских, на которой одной из исламистских группировок было сделано заявление об алжирском такфире. Приблизительно 150–200 тыс. алжирцев погибли во время этой войны, но правительство одержало победу над исламистами.

Еще одной неудачной попыткой Бин Ладена была резня в Луксор 17 ноября 1997 года, которая по заявлениям швейцарской полиции была профинансирована Бин Ладеном. Атака, произведенная шестью боевиками аль-Исламии, переодетыми в полицейских, унесла жизни 58 иностранных туристов и четырех египтян в Храме Луксор. Ее целью было разрушить тенденцию применения ненасильственных мер у Египетского правительства касательно египетской аль-Исламии, основной египетской исламистской группы боевиков.

Последующая атака, которая возымела успех, по крайней мере, временно, была произведена в северном афганском городе Мазар-э-Шариф. Пока Бин Ладен в Афганистане помогал укреплять союз с хозяевами, правящий Талибан послал несколько сотен афгано-арабских солдат, чтобы помочь захватить Мазар-э-Шариф. Город пал, но журналисты докладывали, что там была страшная бойня.